GENOMLINE

APOPTOZ NEDİR ? Apoptoz çok hücreli organizmalarda meydana gelen programlanmış bir hücre ölümüdür.[ 1 ] Biyokimyasal olaylar karakteristik hücre değişikliklerine ve ölüme yol açmaktadır.Bu değişiklikler arasında kabarcıklanma, hücre küçülmesi, nükleer parçalanma kromatin yoğunlaşması ve DNA parçalanması mRNA bozulması bulunmaktadır. Ortalama yetişkin bir insan 50 ile 70 milyar bireyi kaybetmekteyiz.8-14 yaş arası ortlama bireyler için günde yaklaşık 20-30 milyar hücre ölmektedir.[ 2 ] Akut hücresel hasardan kaynaklanan ir travmatik hücre ölümü biçimi olan nekrozun aksine, apoptoz bir organizmanın yaşam döngüsü boyunca avantajlar sağlamaktadır. Oldukça düzenlenmiş ve kontrollü bir süreçtir. Mesela, gelişmekte olan bir insan embriyosunda parmakların ve ayak parmaklarının ayrılması, parmaklar arasındaki hücrelerin apoptoza uğraması nedeniyle oluşmaktadır. Nekroz  farklı olarak, apoptoz adlandırılan hücre fragmanlarını üremektedir.[ 3 ] Apoptoz başladıktan sonra duramayacağından, oldukça d

 TELOMER NEDİR ? DNA'nız, hücrelerinizin çekirdeklerinde bulunur ve burada kromozom adı verilen yapılar içinde paketlenmektedir. Her bir kromozom, genler biçiminde belirli genetik bilgiler taşımaktadır. Vücudunuzdaki hücreler bölünürken, kromozomlarınızın çoğalması gerekmektedir, böylece her hücre çekirdeğinde tam bir kromozom seti içermektedir. Kromozomlarınızın her birinin sonunda telomer adı verilen DNA uzantıları vardır. Telomerler, kromozomlarınızın uçlarını hasara veya yakındaki kromozomlarla kaynaşmaya karşı korumaya yardımcı olmaktadır.  TELOMERLER NEDEN KISALIR ? Bir kromozomun kendini kopyaladığı her seferde DNA zincirleriniz biraz kısalmaktadır. Telomerler, bu süreçte genlerin kaybolmasını önlemeye yardımcı olmaktadır. Ancak, bu kromozomlarınız çoğaldıkça telomerlerinizin kısaldığı anlamına gelmektedir. İşte burada telomeraz adı verilen bir enzim devreye girmektedir. Belirli hücrelerde bulunur ve çok fazla aşınma ve yıpranmayı önlemeye yardımcı olmaktadır. Bu, telomerler

 İngiltere Sağlık Bakanı MAtt Hancock, 14 Aralık günü Parlamentoya yaptığı açıklamada İngiltere' nin güneydoğusunda yeni bir koronavirüs türünün tespit edildiği söylenmektedir. Yeni tanımlanan SARS-CoV-2 türünün, virüsün diğer mevcut türlerinden daha hızlı yayıldığı söylenmektedir. Hancock, yeni koronavirüs varyantının neden olduğu şu ana kadar 1000' den fazla vaka tespit edildiği söylendi, özellikle İngiltere'nin güneyinde ancak rakamlar "hızla artıyor" Dünya Sağlık Örgütü (DSÖ) gelişme hakkında bilgi verildiğini ve Halk sağlığı İngiltere'nin durum analizine devam ettiği söylenmektedir. Hancock ayrıca, COVID-19'a neden olan virüsün yeni türünün daha ciddi hastalıklarla sonuçlanacağına dair hiçbir gösterge olmadığını vurguladı. Ayrıca Hancock, bir aşıya yanıt vermemesinin "pek olası olmadığını" söyledi.Ancak tetikte olmaya devam etmenin önemli olduğuda aynı zamanda da söylenmektedir.  Yeni Bir Koronavirüs Türü Olması Ne Anlama Gelmektedir. Las Ve

  1. Zerdeçal, Güçlü Tıbbi Özellikleri Olan Biyoaktif Bileşikleri İçerir . Zerdeçal, köriye sarı rengi veren bir baharattır. Hindistan'da binlerce yıldır baharat ve şifalı bitki olarak kullanılmaktadır. Son zamanlarda Zerdeçal'ın tıbbi özelliklere sahip bileşikler içerdiği öne sürülmektedir. Bu bileşiklere kurkuminiodler denir ve bunların en önemlisi de kurkumin'dir. Kurkumin, zerdeçalın ana etken maddesidir. Güçlü antienflamatuar etkilere sahiptir ve çok güçlü bir antioksidandır. Bununla birlikte zerdaçalon kurkumin içeriği o kadar yüksek değildir. Ağırlıkça yaklaşık %3' tür.[ 1 ] Bu bitki üzerindeki çalışmaların çoğu, çoğunlukla kurkumin içeren zerdeçal özleri kullanıyor ve dozajları genellikle günde 1 gramı aşmaktadır. Yemeklerimizdeki zerdeçal baharatını kullanarak bu seviyelere ulaşmak çok zor olacaktır. Bu nedenle, tüm etkileri deneyimlemek istiyorsanız, önemli miktarda kurkumin içeren bir takviye almanız gerekmektedir. Ne yazık ki kurkumin kan dolaşımına çok az e

PAGE RNA numuneleri için güçlü bir araçtır.Poliakrilamit jel elektroforezi sonrası denatüre edildekten sonra RNA hakkında bilgi sağlamaktadır.  Poliakrilamit jel elektroforezi bir dizileme deneyinde ortaya çıkan sonlanmış zincir DNA molekül ailelerini incelemek için kullanılmaktadır. Agaroz jel elektroforezi sadece bir nükleotit boyu farklı tek iplikli DNA moleküllerini ayırmak için ihtiyaç duyulan ayrıştırma gücüne sahip olmadığından bu amaçla kullanılamaz. Poliakrilamit jeller agaroz jellerden daha küçük por büyüklüğüne sahiptir ve 10 ila 1500 bç arası moleküllerin hassas ölçüde DNA ayrımları gerektiren, örneğin sadece iki veya üç baz çiftiyle büyüklüğü değişebilen farklı alel ürünleri olan mikrosatellit lokuslarına yönelik PCR' larda amplifikasyon ürünlerinin incelenmesinde de kullanılmaktadır. Poliakrilamit jeller aralayıcılarla ayrı tutulan iki cam levha arasında tabakalar veya kapiler elektroforez için uygun uzun ince kolonlar şekilde hazırlanabilmektedir.                   

 DNA moleküllerindeki mutasyonları saptamada hızlı yöntemler Birçok genetik hastalık bir gen ürünün modifikasyonu veya etkisizleştirilmesiyle sonuçlanan nokta mutasyonlarından kaynaklanmaktadır. Bu mutasyonları tayin yöntemleri iki bakımdan önemlidir. Birincisi bir genetik hastalıktan sorumlu bir gen ilk tanımlandığında, hastalığın durumundan sorumlu mutasyonu veya mutasyonları tanımlamak için bir genin farklı bireylerdeki birçok versiyonunu incelenmesi gereklidir. İkincisi, hastalığa neden olan bir mutasyon karakterize edildiğinde yüksek etkinlikte saptama yöntemlerine gerek olduğu için hekimler mutasyonu taşıyan ve hastalık geliştirme veya onu çocuklarına geçirme riski olan bireylerde tanımlamak için çok sayıdaki DNA örneğini tarayabilmektedir.                                                     Şekil 1: mutasyona uğramış papatya  Herhangi bir mutasyon DNA dizilemesi ile tanımlanmaktadır, ancak dizileme yavaştır. ve çok sayıdaki örneğin taranması için uygun olmayacaktır. DNA çip tekn

 DNA moleküllerini çalışmak içintasarlanan tekniklerin bir çoğu RNA ile kullanmak için uyarlanabilmektedir. RNA' nın agaroz jel elektroforezi her bir molekülün göç hızının tamamıyla uzunluğuna bağlı olması için RNA' nın denatürasyonundan sonra yapılır ve pek çok RNA' da oluşan molekül içi baz eşleşmelerinden etkilenmez. Denatüre edici genellikle formaldehit veya glioksal jele yüklenmeden önce örneğe eklenmektedir.  Northern Hibritleme Bir RNA jelinin naylon bir membrana blotladığı ve işaretli bir pprobla hibritlendiği işlem ifade eder. Bu Southern hibritlemeyle aynıdır ve benzer bir yolla yapılır.  İşaretli RNA Molekülleri   Genellikle işaretli bir ribonükleotit varlığında bir DNA kalıbının RNA' ya kopyalanmasıyla hazırlanmaktadır. SP6, T3 veya T7 bakteriyofajlarının RNA polimeraz enzimleri kullanılır, çünkü bunlar 30 dakika 1mikrogram DNA'dan 30 mikrogram işaretli olarak üretilmektedir.  RNA' nın ayrıca saflaştırılmış poli(A) polimeraz muamelesiyle de ucu işare

 DNA saflaştırmanın ilk adımı DNA'nın elde edileceği hücrelerin yıkılarak açılmasıdır. Bazı malzemelerle bu adım daha kolaydır. Örneğin kültürü  yapılan hayvan hücreleri, hücre zarlarını dağıtıp hücre içeriğini serbest bırakan sodyum dodesil sülfat (SDS) gibi bir deterjan eklenerek kolaylıkla yıkılıp açılmaktadır. Diğer hücre tipleri güçlü duvarlara sahiptir ve dolayısıyla daha şiddetli uygulamalar gerekmektedir. Bu durumda bitki hücresi genellikle dondurulmaktadır. Daha sonra havan ve tokmak kullanılarak ezilmektedir. Bu süreçte selüloz duvarlarının yıkılmasında etkili bir yol olarak görev almaktadır. E.coli olarak bakteriler enzimatik ve kimyasal uygulamaların bir kombinasyonuyla parçalanmaktadır. Kullanılan  enzim bakteri hücre duvarının polimerik bileşiklerini yıkan yumurta beyazıdan elde edilen lizozim ve kimyasal  hücre duvarının sağlamlığını daha fazla düşüren magnezyum iyonlarını tutan etilendiamin tetraasetat'dır (EDTA). Bir deterjan ilavesiyle hücre zarının bozulması,

  Glikojen  Depo  Hastalığı Tip Ia ( Von  Gierke )   Glikojen depo hastalığı tip Ia , otozomal resesif olarak kalıtılan ve mutasyonlar sonucunda glikoz-6-fosfataz (G6PC )enzim eksikliğine neden olan nadir bir   hastalıktır. Glikoz-6-fosfataz enzimi    karaciğer, böbrekler ve bağırsaklarda bulunmaktadır. Bununla birlikte karaciğer glikoz-6- fosfataz   enzim eksikliği görülmesi depolanmış glikojeni parçalama yeteneğini bozar. Büyüme geriliği, hipoglisemi, hepatomegali, böbrek büyümesi, hiperlipidemi, hiperürisemi ve laktik asidemi ile karakterize fonksiyonel glikoz-6-fosfataz eksikliğini gösterir.[1]   Şekil 1:  Von Gierke hastalığının karaciğer biyopsisi örneği. Berrak sitoplazma zengin glikojen içerir.[7] Glikoz-6-fosfataz  (G6PC) Karaciğerdeki glikojen   yıkımının öğünler arasında kan glukoz derişiminin düştüğü zaman kana glukoz salınması gibi farklı görevleri vardır. Bunun için sadece karaciğer ,böbrekler ve bağırsaklarda bulunan glukoz-6-fosfataz enzimi kullanılır. G6PC

ATMOSFER KİMYASI Atmosfer kimyası, Dünya atmosferinin ve diğer gezegenlerin atmosferlerinin kimyasının çalışıldığı atmosfer bilimin bir dalıdır. çok disiplinnli bir araştırma yaklaşımlar ve çevre kimyası, fizik, meteoroloji, bilgisayar modelleme, oşinografi, jeoloji ve volkanoloji ve diğer disiplinlerden yararlanmaktadır. Araştırma, Klimatoloji gibi diğer çalışma alanlarıyla giderek daha fazla bağlantılıdır. Dünya atmosferinin bileşimi ve kimyası birkaç nedenden ötürü önemli hale gelmektedir, ancak öncelikle atmosfer ile canlı organizmalar arasındaki etkileşimler nedeniyle dünya atmosferinin bileşimi, volkan emisyonları, şimşek ve koronadan gelen güneş parçacıklarının bombardımanı gibi doğal süreçler sonucunda değişmektedir. Ayrıca insan faaliyeti tarafından değiştirilmiştir ve bu değişikliklerin bazıları insan sağlığına, mahsullere ve ekosistemlere zararlıdır. Atmosferik kimyada ele alınan sorunların örnekleri arasında asit yağmuru, ozon incelmesi, fotokimyasal duman, sera gazları ve

Protein Sentezinde Prokaryot ve Ökaryot Arasındaki Farklar  İnsan genom projesi ile "Genom, Genomik, Proteom, Proteomik, Transkriptom, Transkriptomik " gibi terimlerle sık sık karşılaştık. Moleküler biyoloji ve genetik bölümünü okurken açıkçası en zorlandığım derslerden biride "Proteomik" ti üstelik ben bu dersi birinci sınıfın yaz döneminde iken üçüncü sınıf dersi olarak üstten almıştım. Bu süreçte zorlanmamakta kaçınılmazdı. Elimde gerekli notlar bulunmaktaydı. Ancak, tam olarak konuyu kavrayacak bir şekilde değildi. Ben de bu dersi tam anlamak adına ve ders hem prokaryot hem de ökaryotik hücre üzerinden işlendiği için ben de bu iki hücrenin protein sentezi aşamasında aralarındaki farkları çıkarmaya başladım. Sonuç olarak elbette işe yaradı üstten aldığım dersin finalinden yüksek bir puan alarak geçmiştim. Protein sentezinde prokaryot ve ökaryotik hücre farklılıkları ile ilgili çok detaylı bilgilendirici bir site vs. bulamadım. Bu notları tamamen kendim çıkarmış b