GENOMLINE

  Doğa Bahçeci - Moleküler Biyoloji ve Genetik, Doğu Akdeniz Üniversitesi  Tanımı   Epitel hücrelerinin polarite ve adezyon gibi özelliklerinin kaybolmasıyla sonuçlanan yeniden şekillenme süreci; mezenkimal hücrelerin rahimdeki gelişim, erişkinlerde dokuların yenilenmesi veya kanserin ilerlemesi sırasında istila ve göç gibi özelliklerinin alınmasına Epitelyal Mezenkimal Geçiş (EMT) denir [1, 2 ve 3].   1. Tür: Embriyolojik olarak   Rahimdeki gelişim sırasında bir embriyonun EMT'sinden geçmek doğal ve gereklidir. Tip I EMT yüksek düzeyde organize edilmiştir [1]. Blastosist endometriumu bağlamadan önce 1° EMT olabilir. Gastrula'nın organizasyonu sırasında, orta tabaka EMT'nin yanı sıra nöral krest adı verilen en dış tabakadan kaynaklanan geçici bir omurgalıya özgü hücre grubu tarafından oluşturulur. Bu hücre gruplarının ve mezenkimal hücrelerin farklılaşma özellikleri etkilenmez [4]. 2° EMT sırasında son hedefe geçişten sonra nöral krest farklılaşması meydana gelir. Bir orta

  Metabolom, tek bir organizma gibi biyolojik bir numune içinde bulunacak küçük moleküllü (<1.5 kDa) metabolitlerin (metabolik ara ürünler, hormonlar ve diğer sinyal molekülleri ve ikincil metabolitler gibi) tam setini ifade eder.  Kelime, transkriptomik ve proteomik ile analoji içinde türetilmiştir; Transkriptome ve proteom gibi, metabolom da dinamiktir, saniyeden saniyeye değişir. Metabolom kolayca tanımlanabilse de, şu anda tüm metabolit aralığını tek bir analitik yöntemle analiz etmek mümkün değildir. Tandem kütle spektrometrisi deneylerinden parçalanma verilerini aramak için ilk metabolit veri tabanı (METLIN olarak adlandırılır), 2005 yılında The Scripps Araştırma Enstitüsü'ndeki Siuzdak laboratuvarı tarafından geliştirilmiştir. METLIN, her biri deneysel tandem kütle spektrometrisi verilerine sahip olan 450.000'den fazla metabolit ve diğer kimyasal varlıkları içerir. 2006 yılında, Siuzdak laboratuvarı ayrıca kütle spektrometrisi metabolomik verilerinin doğrusal olmayan