Kayıtlar

protein etiketine sahip yayınlar gösteriliyor
Loading

Metabolom

Resim
  Metabolom, tek bir organizma gibi biyolojik bir numune içinde bulunacak küçük moleküllü (<1.5 kDa) metabolitlerin (metabolik ara ürünler, hormonlar ve diğer sinyal molekülleri ve ikincil metabolitler gibi) tam setini ifade eder.  Kelime, transkriptomik ve proteomik ile analoji içinde türetilmiştir; Transkriptome ve proteom gibi, metabolom da dinamiktir, saniyeden saniyeye değişir. Metabolom kolayca tanımlanabilse de, şu anda tüm metabolit aralığını tek bir analitik yöntemle analiz etmek mümkün değildir. Tandem kütle spektrometrisi deneylerinden parçalanma verilerini aramak için ilk metabolit veri tabanı (METLIN olarak adlandırılır), 2005 yılında The Scripps Araştırma Enstitüsü'ndeki Siuzdak laboratuvarı tarafından geliştirilmiştir. METLIN, her biri deneysel tandem kütle spektrometrisi verilerine sahip olan 450.000'den fazla metabolit ve diğer kimyasal varlıkları içerir. 2006 yılında, Siuzdak laboratuvarı ayrıca kütle spektrometrisi metabolomik verilerinin doğrusal olmayan

MikroRNA (miRNA)

Resim
 Bir mikroRNA (kısaltılmış miRNA), bitkilerde, hayvanlarda ve bazı virüslerde bulunan, RNA susturma ve gen ekspresyonunun transkripsiyon sonrası düzenlenmesinde işlev gören küçük, tek iplikli, kodlamayan bir RNA molekülüdür (yaklaşık 22 nükleotit içerir). miRNA'lar, mRNA molekülleri içindeki tamamlayıcı dizilerle baz eşleşmesi yoluyla işlev görür. Sonuç olarak, bu mRNA molekülleri, aşağıdaki süreçlerin bir veya daha fazlası ile susturulur: (1) mRNA ipliğinin iki parçaya bölünmesi, (2) poli(A) kuyruğunun kısaltılması yoluyla mRNA'nın istikrarsızlaştırılması ve ( 3) mRNA'nın ribozomlar tarafından proteinlere daha az verimli çevirisi. miRNA'lar, RNA interferans (RNAi) yolunun küçük enterferans yapan RNA'larına (siRNA'lar) benzer, ancak miRNA'lar, kısa saç tokaları oluşturmak üzere kendi üzerlerine katlanan RNA transkript bölgelerinden türetilirken, siRNA'lar çift sarmallı RNA'nın daha uzun bölgelerinden türetilir. İnsan genomu 1900'den fazla miRNA&#

JAK-STAT Sinyal Yolağı

Resim
 JAK-STAT sinyal yolu, bir hücredeki proteinler arasındaki bir etkileşimler zinciridir ve bağışıklık, hücre bölünmesi, hücre ölümü ve tümör oluşumu gibi süreçlerde yer alır. Yol, bir hücrenin dışındaki kimyasal sinyallerden hücre çekirdeğine bilgi iletir, bu da transkripsiyon adı verilen bir süreç yoluyla genlerin aktivasyonu ile sonuçlanır. JAK-STAT sinyallemesinin üç anahtar parçası vardır: Janus kinazlar (JAK'ler), sinyal dönüştürücü ve transkripsiyon proteinlerinin (STAT'ler) aktivatörü ve reseptörler (kimyasal sinyalleri bağlayan). Bozulmuş JAK-STAT sinyali, cilt rahatsızlıkları, kanserler ve bağışıklık sistemini etkileyen bozukluklar gibi çeşitli hastalıklara yol açabilir. JAK'ların ve STAT'lerin Yapısı Dört JAK proteini vardır: JAK1, JAK2, JAK3 ve TYK2.[1] JAK'lar bir FERM alanı (yaklaşık 400 kalıntı), SH2 ile ilgili bir alan (yaklaşık 100 kalıntı), bir kinaz alanı (yaklaşık 250 kalıntı) ve bir psödokinaz alanı (yaklaşık 300 kalıntı) içerir. Kinaz alanı, JAK&